• <p id="64vec"><del id="64vec"><xmp id="64vec"></xmp></del></p>
    <p id="64vec"><strong id="64vec"><xmp id="64vec"></xmp></strong></p>

    <track id="64vec"><ruby id="64vec"></ruby></track>
    <p id="64vec"><strong id="64vec"><xmp id="64vec"></xmp></strong></p>
    <track id="64vec"></track>
    <acronym id="64vec"><label id="64vec"></label></acronym>
  • 这是描述信息

    DNA 6mA免疫沉淀测序 (6mA-IP Seq)

    项目介绍
    参数
    常见问题
    应用案例

     

    DNA 6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)

     

    N6-甲基脱氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修饰类型之一,

    在细菌、藻类及植物基因组中广泛存在,在DNA错配修复、染色体分离和毒力调节中发挥作用。

    6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)通过特异性抗体富集6mA甲基化的DNA片段,结合NGS测序技术在全基因组水平上分析6mA修饰信息。

     

    用心服务每一个项目

    专注表观组学10年,提供专业有价值的DNA甲基化完整解决方案;

    国内较早开发6mA-seq技术团队之一, 严格的内参质控;

    已经完成藻类及动植物及人等多个物种6mA-seq项目经验;

    专业的生物信息分析团队, 提供更多个性化分析思路和方案。

     

     

    科学方案设计

    从项目方案、样本处理、建库测序,到数据分析;

    每个项目需要专业、有价值的建议;及时高效的沟通,以保障高质量研究成果。

     

     

    样本类型和要求

    样本类型

    样本要求

    基因组DNA

    总量≥ 5ug; 浓度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量

    动植物、藻类、低等生物等

    按照送样要求准备

    备注:用封口膜密封样品; 干冰运输

     

     

    数据分析

    6mA-IP Seq

    分析内容

    备注

    标准分析

    1、测序数据质量评估

    过滤掉低质量数据,保证数据质量

    2、与参考基因组比对

    测序Reads 在基因组上的分布

    3、6mAPeak峰Calling

    6mADNA富集区域鉴定

    4、6mAPeak图谱分析

    6mAPeak在基因组,染色体,功能元件上的分布

    6、组间差异6mAPeak分析

    寻找6mADMR及注释

    7、差异6mAPeak基因分析

    相关基因GO,KEGG富集分析

    高级分析

    8、多组学整合关联分析

    例如与转录组关联分析

    9、其它定制化分析

    结合课题背景亮点挖掘

     

     

     

    未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

     

    案例分析:衣藻基因组6mA甲基化谱研究

    N6-Methyldeoxyadenosine Marks Active Transcription Start Sites in Chlamydomonas.Cell. 2015;7;161(4):879-892.

    一、研究背景

    N6-甲基脱氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修饰类型。6mA在细菌中广泛存在,在DNA错配修复、染色体分离和毒力调节中发挥作用。相比之下,6mA在真核生物中的分布和功能还不清楚。

    二、方法流程

    取材:单衣藻(Chlamydomonas)

    测序:6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)

    验证:UHPLC-MS/MS: 整体6mA水平

    三、研究结果

    1、对衣原体基因组中的6mA进行了全面的分析,在84%的基因中鉴定出6mA修饰;

    2、6mA主要位于转录起始位点(TSS)附近的AT二核苷酸上,具有双峰分布,并显示出激活基因的标记;

    3、在6mA分布存在周期性模式, 与TSS附近的核小体分布有关,表明在核小体位置上可能起到作用。

    四、研究结论

    6mA的全基因组图谱及其在衣藻基因组中的独特分布表明6mA在真核生物基因表达中的潜在调控作用

     

    这是描述信息

    邮箱:marketing@sz-acegen.com

    官网:http://www.jiifuu.com

    地址:深圳市龙岗区立信路43号永昌大厦407-408室

    Copyright ? 2021  |  深圳市艾斯基因科技有限公司 All Rights Reserved.  |   粤ICP备16072881号  |  网站建设:中企动力 龙岗

    九九99国产香蕉视频_天天摸天天添天天爱_家庭教师在线观看国语_日韩中文欧美在线视频 遂宁市| 苍溪县| 乐业县| 伊通| 东源县| 广丰县| 凤台县| 阜南县| 达孜县| 依兰县| 卢氏县| 色达县| 册亨县| 巴青县| 齐河县| 四会市| 宁阳县| 高雄市| 浦县| 井陉县| 广安市| 锡林郭勒盟| 太谷县| 新邵县| 武功县| 河西区| 双鸭山市| 长阳| 平顶山市| 玉溪市| 定南县| 嫩江县| 屯昌县| 厦门市| 达拉特旗| 哈密市| 瓦房店市| 聂荣县| 万山特区| 泾阳县| 许昌县| http://444 http://444 http://444 http://444 http://444 http://444